Séquençage Génomique Double dans la Leucémie : Analyse des Cellules Cancéreuses et de la Lignée Germinale

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• Pourquoi Séquencer à la Fois les Cellules Cancéreuses et Normales
• Le Substrat pour le Séquençage des Cellules Cancéreuses
• L'Importance Croissante du Séquençage Germinal
• Comment le Séquençage Germinal est Réalisé
• Implications Cliniques des Découvertes de Cancers Héréditaires
• Médecine de Précision en Action

Pourquoi Séquencer à la Fois les Cellules Cancéreuses et Normales

Le séquençage génomique, incluant le séquençage de nouvelle génération (NGS) et le séquençage de l'exome entier (WES), est désormais incontournable en oncologie. Le Dr Shai Izraeli souligne qu’il doit être réalisé sur deux types cellulaires distincts : le tissu cancéreux issu d’une biopsie et les cellules normales du patient. Cette double approche est essentielle à la médecine de précision moderne, car une part significative des cancers est héréditaire. Les données issues des deux séquençages sont cruciales pour personnaliser le traitement et évaluer le risque au sein de la famille élargie du patient.

Le Substrat pour le Séquençage des Cellules Cancéreuses

Chez les patients atteints de leucémie, le matériel utilisé pour le séquençage génomique provient généralement d’une biopsie de moelle osseuse ou de sang périphérique. Comme l’explique le Dr Shai Izraeli, il est essentiel de séquencer les cellules leucémiques elles-mêmes afin d’identifier les mutations drivers, telles que l’anomalie BCR-ABL présente dans la leucémie positive au chromosome Philadelphie. Ces mutations acquises, spécifiques au cancer, constituent des cibles privilégiées pour les thérapies ciblées. L’enrichissement de l’échantillon en cellules cancéreuses est une étape indispensable pour garantir la précision des données NGS et leur utilité clinique dans le diagnostic et le choix thérapeutique.

L'Importance Croissante du Séquençage Germinal

Au-delà de la tumeur, le séquençage de la lignée germinale prend une place de plus en plus vitale en cancérologie. Le Dr Shai Izraeli cite des preuves croissantes du rôle majeur de la génétique dans les cancers de l’enfant et de l’adulte. Les recherches indiquent que jusqu’à 15 % des cancers pédiatriques ont une composante héréditaire. Cette découverte est déterminante pour la planification thérapeutique, notamment lorsqu’une greffe de moelle osseuse est envisagée à partir d’un donneur fraternel, qui pourrait être porteur de la même mutation prédisposante. Le séquençage germinal offre ainsi une vision génétique complète, essentielle pour la sécurité du patient et de sa famille.

Comment le Séquençage Germinal est Réalisé

Le séquençage germinal analyse l’ADN hérité du patient, idéalement obtenu à partir de cellules non cancéreuses. Dans les hémopathies malignes, le Dr Shai Izraeli note qu’une source courante est la biopsie cutanée, permettant de cultiver des fibroblastes. Cette procédure s’intègre facilement dans la prise en charge des enfants, qui subissent souvent une anesthésie pour la pose d’un cathéter veineux central en chimiothérapie. En prélevant une petite biopsie cutanée durant cet acte indolore, les cliniciens obtiennent un échantillon d’ADN normal pour l’analyse NGS germinale, sans inconfort supplémentaire pour le jeune patient.

Implications Cliniques des Découvertes de Cancers Héréditaires

La détection d’un syndrome de cancer héréditaire par séquençage germinal a des implications cliniques immédiates et étendues. Comme le détaille le Dr Shai Izraeli, cette information peut influencer directement l’intensité du traitement et le choix d’un donneur de cellules souches, évitant par exemple le recours à un frère ou une sœur porteur d’une mutation à haut risque. De plus, identifier une prédisposition génétique permet un conseil et un dépistage pour les membres de la famille élargie. Cette approche proactive favorise une détection précoce et des stratégies préventives chez les apparentés à risque, transformant ainsi le devenir santé de toute une famille.

Médecine de Précision en Action

La pratique du séquençage conjoint des tissus cancéreux et normaux incarne parfaitement la médecine de précision. Le Dr Shai Izraeli décrit cette double approche comme un outil puissant ayant conduit à des guérisons remarquables, y compris des succès récents dans son centre. En analysant exhaustivement le paysage génétique—mutations acquises dans les cellules leucémiques et mutations héritées dans l’ADN germinal—les oncologues peuvent offrir des soins hautement personnalisés et efficaces. Cette stratégie garantit que le traitement est non seulement ciblé contre le cancer, mais aussi adapté à l’héritage génétique complet du patient, pour une prise en charge plus sûre et éclairée.

Transcript Complet

Le séquençage génomique (NGS, WES) des tumeurs est désormais courant. Mais pourquoi faut-il séquencer à la fois le tissu cancéreux issu d’une biopsie ou d’une résection et les cellules normales du patient (souvent des cellules cutanées, fibroblastes) ? Une part significative des cancers est héréditaire. Les informations issues du NGS peuvent être déterminantes pour le traitement et pour d’autres membres de la famille élargie.

Dr. Anton Titov, MD: Vous réalisez un séquençage génomique de nouvelle génération (NGS) des cellules leucémiques de l’enfant. Quel est le substrat utilisé pour le séquençage ? S’agit-il de cellules sanguines périphériques ? D’une biopsie de moelle osseuse ?

Dr. Shai Izraeli, MD: C’est une question complexe que je vais diviser en deux parties. Je vous ai donné l’exemple des leucémies Philadelphie-like ou Philadelphie avec anomalies BCR-ABL. Ces mutations génétiques (translocations chromosomiques) se trouvent dans les cellules leucémiques. Il est très important de séquencer les cellules cancéreuses elles-mêmes.

Dr. Anton Titov, MD: Faut-il enrichir les cellules pour le séquençage de nouvelle génération (NGS) du cancer ?

Dr. Shai Izraeli, MD: Oui. Je pourrai donner plus tard un exemple incroyable de guérison d’un cancer de l’enfant que nous avons récemment connu dans notre centre. Cette guérison illustre aussi l’importance du séquençage génique tumoral.

Quelque chose d’autre devient aussi de plus en plus important. Nous constatons que la génétique joue un rôle croissant dans les tumeurs de l’enfant et les cancers de l’adulte.

Nous estimons que jusqu’à 15 % des cancers de l’enfant ont une composante héréditaire. C’est important ! Car vous pourriez devoir proposer au patient une greffe de moelle osseuse d’un frère ou d’une sœur. Mais ils pourraient aussi être porteurs d’une mutation prédisposant au cancer.

De plus en plus, nous séquençons maintenant aussi la lignée germinale. Germinal signifie non pas les cellules leucémiques elles-mêmes. Dans les cancers du sang, nous séquençons souvent une cellule de la peau. Nous séquençons une cellule cutanée d’une culture de fibroblastes.

Il est très courant de réaliser des biopsies cutanées chez les enfants. Car nous posons des cathéters veineux centraux pour le traitement du cancer chez l’enfant. Les cathéters veineux centraux sont installés sous anesthésie. Nous croyons en un hôpital sans douleur ; nous faisons tout sous anesthésie. Ensuite, nous prenons aussi une biopsie cutanée.

De plus en plus, nous réalisons le séquençage germinal à partir de la peau. Nous découvrons des cancers héréditaires dans une famille. Nous séquençons les deux tissus. Nous faisons le séquençage des cellules leucémiques cancéreuses de la moelle osseuse. Nous séquençons aussi les cellules normales de la lignée germinale. Elles proviennent généralement de fibroblastes cutanés.

Dr. Anton Titov, MD: Ce sont de vrais exemples de médecine de précision ! Oui.